在鱼苗培育过程中，由于鱼苗个体较小，活动能力差以及饲养管理条件和环境因子的作用常受到一些病害与敌害的危害，直接影响到鱼苗的成活率，现介绍几种对鱼苗鱼种危害较大的常见病害和敌害的防治方法。白头白嘴病。主要危害放养一周后的夏花鱼种，病鱼的吻部及头部呈乳白色，该病属急性病，发病迅速，易致鱼苗大批量死亡。其防治可用含有效氯30％的漂白粉全池泼洒1～2次，浓度为1ppm。
小瓜虫病：在病鱼的鳃部及体麦形成“小白点”，虫体多时易致鱼死亡。此病可用0.1～0.2ppm的硝酸亚汞或孔雀石绿全池泼洒来防治或采用辣素疗法，即用1.5ppm于辣椒粉1ppm的生姜合剂加水煮沸30分钟兑水全池泼洒，每日一次，连续2～3次，疗效好又经济。切勿用硫酸铜来，否则，不但不能治好，而且会加重鱼的病情。
车轮虫病：该虫体寄生于鱼体表与鳃部，刺激鱼体产生大量粘液，出现“红头白嘴”现象，对夏花鱼种危害较大。可用0.7ppm硫酸铜在硫酸亚铁合剂(5：2)全池泼洒来防治，也可用苦楝树枝叶按每亩池塘每米水深用60斤煮汁全池泼洒来。
剑水蚤：这是鱼菌生长期的主要敌害之一，当水温在18℃以上时，水质较肥的鱼池中剑水蚤易繁殖，既会咬死鱼苗，又消耗池中溶氧，影响鱼苗生长。直接而有效的防治方法就是每亩池塘每米水深用90％的晶体敌百虫0.3～0.4公斤兑水溶解后全塘泼洒。
水蜈蚣：该敌害对鱼苗危害很大，一只水蜈蚣一昼夜大红约可夹死鱼苗30尾，其防治方法有两种，一种是点灯诱杀，即在无风夜晚用木框架浮于池塘水面上，并用小竹杆固定，在框内撒一些柴油或煤油，同时点一盏灯，利用水蜈蚣的趋光性将水蜈蚣诱集于框下，使之触油后窒息死亡。另一种方示是用花椒果和菜油来杀灭。将花椒果放入锅中烧枯研碎，再将菜油烧开，趁热倒入油内拌匀，冷却后在傍晚时全池泼洒，用量为每亩池塘用花椒果和菜油各1～1.5公斤。
青泥苔和水网藻：当鱼苗游入布满青泥苔和水网藻内时常被缠死，且这些藻类还会消耗水中养分，使池水变瘦，影响鱼苗正常生长。防治时，可用草木灰覆盖于青泥苔和水网藻滋生处，以控制其生长繁殖或用0.7ppm硫酸铜全池泼洒。另外，也可按每立方米水体用生石膏粉80克分三次均匀全池泼洒，每次间隔时间3～4天，若青苔严重时用量增加20克，放药在下午喂鱼后进行，放药后注水10～20厘米效果更好。此法不会使池水变瘦，也不会造成缺氧，半月内可全杀灭青苔。