投标保函是指在招标投标中，招标人为保证投标人不得撤销投标文件，中标后不得无正当理由不与招标人签订合同等，要求投标人在提交投标文件时一并提交的一般由银行出具的书面担保。
投标保证金是指在招标投标活动中，投标人随投标文件一同递交给招标人的一定形式、一定金额的投标责任担保。其主要保证投标人在递交投标文件后不得撤销投标文件，中标后不得无正当理由不与招标人订立合同，在签订合同时不得向招标人提出附加条件、或者不按照招标文件要求提交履约保证金，否则，招标人有权不予返还其递交的投标保证金。
保证金存在被收取者挪用的风险，而且对是否挪用难以监控。虽然法律上明文规定保证金不允许挪用，但事实上或多或少，无论是招标代理机构，还是招标人，什么有些政府交易平台，都存在一些保证金挪用的现象，如果挪用的大额保证金不能及时归还，对投标人会造成损失。
投标人由于需要到处参加投标，保证金交纳笔数多了以后，累计数额也是不小的。或多或少影响了投标人的现金流，一方面造成这些资金的无效沉淀，一方面在投标人资金紧张后又加大了它外部融资的成本，间接提高企业的生产成本，招标人的采购价格。