曾学军教授参与了国内目前所有关于痛风和高尿酸血症指南的制定工作， 2013 年牵头制定了《高尿酸血症社区管理规范草案》，2018年11月在中华全科医师杂志上发表修订版《高尿酸血症社区管理流程的专家建议》，2020年4月再次牵头制定《痛风及高尿酸血症基层诊疗指南》。
在医疗实践的同时，曾学军教授致力于临床医学教育，任美国内科医师学会（ACP）Fellow、美国医学研究所（IOM）中国医学教育代表。曾荣获北京市高等教育改革二等奖、 “住院医师心中好老师”、北京市师德先进个人、北京协和医学院教学名师等荣誉，带领普通内科获得2015年北京协和医学院教学团队称号。2019年2月入选十大社区健康促进首 席专家。
北京协和医院风湿免疫科从建科时仅有3张病床的小科室发展到今天，协和风湿免疫科已拥有68张病床，年收治患者1500例次以上，年门诊量逾12万人次，不仅注重系统性红斑狼疮、干燥综合征、类风湿关节炎、强直性脊柱炎等常见风湿性疾病的规范诊治，更强调对少见风湿性疾病、风湿性疾病重要脏器损害以及风湿性疾病严重并发症的综合诊治，追求更精 确的诊断、更细致的评估、更有效的治 疗效果。
面对众多前来求助的风湿病患者，北京协和医院风湿免疫科紧抓高质量医疗服务不放松。针对门诊及住院患者中的疑难病例，科室每周组织专业组查房进行集中会诊；陆续开展线上诊疗、视频三级查房，确保患者就医的连续性；建立完善多个专病门诊，缩短患者诊疗周期，改善患者就诊体验……